Materská škola Estónska č. 3 začala písať svoju históriu v januári 1975 ako Materská škola Bieloruská s riaditeľkou Vlastou Neverišovou. V roku 1992 bol jej názov v rámci územného riešenia zmenený na Materskú školu Estónska č.3 a do riaditeľskej funkcie nastúpila Anna Brániková.
V januári 1998 sa stala školou s právnou subjektivitou a združovala všetky materské školy v Miestnej časti Bratislava Podunajské Biskupice pod vedením riaditeľky p. Anny Bránikovej.
Na základe právnej legislatívy v januári 2004 bol tento právny subjekt rozdelený na dva právne subjekty .
Materské školy Estónska 7 a Podzáhradná 1 boli vyradené zo siete materských škôl a stali sa elokovanými triedami Materskej školy Estónska č.3.
Materská škola Estónska 7 bola otvorená v auguste 1975 , vyradená zo siete bola v januári 2004 .
Materská škola Podzáhradná 1 bola otvorená v septembri 1988 , vyradená zo siete bola v januári 2004.
Materská škola Estónska 3 je školou s právnou subjektivitou, má 14 tried s kapacitou cca 300 detí.
v súčasnosti tu pracuje 28 pedagogických zamestnancov,
7 správnych zamestnancov,
11 zamestnancov školskej jedálne vrátane vedúcich a
2 administratívne zamestnankyne.
Riaditeľkou Materskej školy je Mgr. Lenka Hricková, ktorá má ukončené vysokoškolské vzdelanie II.stupňa v odbore "Učiteľstvo pre 1.stupeň základnej školy; predškolská pedagogika". Od šk. roku 2003/2004 pôsobila ako učiteľka a neskôr ako zástupkyňa na elokovanom pracovisku Estónska 7. Od 1.7.2014 je riaditeľkou celého právneho subjektu so sídlom na Estónskej 3.
Štatutárnou zástupkyňou elokovaného pracoviska na Estónskej 7 je od šk. roka 2016/2017 Mgr. Miriam Vaverčáková.
Štatutárnou zástupkyňou elokovaného pracoviska na Podzáhradnej 1 je od šk. roka 2017/2018 Ľubica Žiaková.
Pracujeme podľa Školského vzdelávacieho programu s názvom Zvedavé deti, ktorý vychádza z úloh Štátneho vzdelávacieho programu a úloh profilácie materskej školy.
Do programu sú zapracované úlohy projektu Školy podporujúcej zdravie projektu Škola plná pohybu, práca s talentovanými deťmi a metodiky Krok za krokom.
MŠ je zameraná na poskytovanie komplexnej starostlivosti o vaše dieťa na vysokej odbornej a profesionálnej úrovni, ktorú zabezpečujú odborne zdatní pedagógovia a personál MŠ.